HPC如何助力提升醫藥研發進程

在醫藥生產制造領域,科研是一切基礎。加速研發能力不僅可以成就企業,趕超競爭對手,最重要的是可以挽救更多生命。
在助力提升研發過程中,HPC起到了至關重要的作用。接下來我們來看看設計HPC基礎架構都需要考慮哪些關鍵因素,才能顯著提高性能并最大化集群價值。
 
 
 
1
如何最大化 HPC/AI 性能?
 
首先,我們建議您使用較為信賴的合作伙伴提供的軟硬件和同行業最佳的技術方案,這樣可以在預算內得到最大的節點優化。盡量避免了只和一家供應商合作,容易導致陷入更高價格但性能沒有得到相應提升的風險,如果多家供應商比價競標,能更好的保證投資回報率,增加了靈活性,并在合理的預算內提供更好的軟硬件性能。
其次,使用可組合式分類基礎架構(CDI,composable disaggregated infrastructure) 也是提高性能的很好選擇。簡而言之,CDI 是指使用軟件來匯集硬件資源,因此它們可以動態組合以滿足不斷變化的工作負載需求。因此,您能夠在集群上運行不同的項目,同時仍然針對每個獨特的工作負載進行優化。
您還應該確保您的集群設計是能夠根據不斷變化的工作負載可以輕松擴展的。通過利用CDI,可以動態擴展單個資源池,例如GPU、加速器或存儲。您可以無縫地將資源添加到集群中并將它們置于管理之下,另外還應該針對線性可擴展性進行設計,以便集群性能和存儲可靠性隨著不斷添加到集群中的每個節點而提高。
但是,即使不使用CDI,如果您的集群設計人員使用模塊化設計,您也應該能夠根據需要擴展計算、存儲和網絡組件。
 
2
如何提高 HPC/AI 數據管理和投資回報率?
 
傳統的NAS 解決方案在達到其瓶頸之前可以運行高達10Gb/s,這導致藥物研發工作負載時間過長,可以使用NVMe 存儲作為臨時解決方案,但這意味著數據會在節點之間不斷復制,會導致網絡流量過高,產生另外一個瓶頸。
軟件定義存儲(SDS) 是數據管理的絕佳解決方案。通過將服務器與SDS 配對,可以將IO 帶寬提高多達傳統服務器的10 倍。該解決方案還通過創建所有計算節點都可以讀取或寫入的單一命名空間數據池,消除了節點到節點的持續復制,還可以通過將符合S3標準的對象存儲在本地或公有云中分層來降低總成本。
 
 
3
如何提高 HPC/AI 效率?
 
針對醫藥企業專門構建的集群可以真正優化藥物研發的時間,其中CDI架構值得考慮,因為它能使您的員工在不遇到瓶頸的情況下執行研發任務,并允許您無縫擴展,同時保持高級別的安全性。
裸金屬性能(或與CDI 相當的性能)也是比較理想的一種方式。如果您正在考慮將AI 解決方案部署到云端,理想情況下,它們應該位于同一個數據中心,如果您是混合模式,則成本最高的資源應該在本地。
最后您還可以使用NVMe 和強大的(10 GbE) 網絡技術,通過網絡提高效率。
我們推薦NVIDIA/Mellanox 200Gb/s HDR InfiniBand,您的存儲也應該是高度并行的,并支持大型單一命名空間。
 
天云Tips
Composable disaggregated Infrastructure 可組合式分類基礎設施消除了對特定工作負載環境的需求,并提供了一組可動態組合的靈活資源,以滿足任何應用程序的獨特需求。它提供了最佳的應用程序性能,避免資源浪費和過度投資,并創建了一個更靈活、更具成本效益的數據中心。
有了可組合的基礎設施,IT 可以像搭積木(像公有云那樣)快速、輕松地部署定制化的IT基礎設施。這篇文章在構建高效的藥物研發HPC機群時就用了這個技術,達到了投資性能的優化回報。除此之外在網絡和共享存儲方面有進行了優化以配合整體性能的提高。
 
 
——天云融創軟件首席科學家 張福波
 

 

推薦閱讀 

在線咨詢 MESSAGE

姓名 *

電話 *

郵箱 *

咨詢意向 *

公司名稱

所屬行業

需求概述 *

{转码词},{转码词1},{转码词2},{转码词3}